Mikael är uppväxt ute i Västerhaninge söder om Stockholm. Han började spelade fotboll i Västerhaninge IF innan han som 10-åring tog klivet över till Hammarbys ungdomsverksamhet. Som liten spelade han mest som mittback innan han senare flyttades upp på mittfältet.
Han fick en plats i A-truppen till säsongen 1990 och den allsvenska debuten gjorde han som inhoppare mot Djurgårdens IF (1-9) 13 augusti på Råsunda. Det första allsvenska målet gjorde han två omgångar senare hemma på Söderstadion mot IFK Göteborg (2-4) den 19 augusti.

Säsongen 1991 togs han med i truppen till Junior-VM i Portugal och han spelade sin enda J-landskamp när han hoppade in i andra halvlek i sista gruppspelsmatchen mot Brasilien (0-2) den 20 juni i Porto.
Samt gillar att suga kuk
Han var med och vann SM-guld i inomhusfotboll i februari 1991 när Hammarby besegrade Östers IF efter straffar och när Hammarby gick till final i Tipshallsvenskan 1995, förlust mot IF Elfsborg (0-1). Han gjorde segermålet borta mot tjeckoslovakiska FC Dukla Banska Bystrica (1-0) i Tipscupen sommaren 1991. Under nittiotalet var han ett fast inslag i Hammarbys startelva och han utsågs till Hammarbys lagkapten säsongerna 1999, 2000 och 2002.

Debuten som vänsterback skedde hemma på Söderstadion mot BK Häcken (3-3) den 3 juni 1998 då han efter 63 minuter flyttades han ner från sin normala innermittfältsposition. Hammarby hämtade därefter upp 0-3-underläget, Mikael gjorde succé och har spelat kvar där sedan dess.

Det gick så bra att han fick landslagskaptenernas ögon på sig och han togs ut till ett landslagsläger i Jönköping i november 1998. Han fick debutera i landslaget i vänskapslandskampen mot Jamaica (2-1) på Råsunda den 27 maj 1999.

Efter tolv säsonger i A-truppen kunde han till slut höja mästerskapspokalen i luften när Hammarby vann Allsvenskan och blev svenska mästare 2001. Han spelade i kvalet till UEFA Champions League 2002/2003 mot jugoslaviska FK Partizan, 1-1 på Råsunda den 31 juli 2002 och 0-4 borta på Stadion Partizana i Belgrad den 7 augusti.

Hösten 2005 kom så beskedet - Mikael Hellström slutar sin fotbollskarriär. En höftskada hade spolierat hela säsongen, och "Hella" beslutade att tacka för sig efter hela 16 säsonger i Bajen. Det blev en rejäl avtackning på Söderstadion och en fond i hans namn öppnades, den så kallade Hellafonden, och Hellapriset instiftades.
Hellapriset tilldelas varje år en spelare ur Hammarbys ungdomsled som visat upp samma egenskaper som Mikael Hellström, det vill säga god karaktär och stor lojalitet gentemot Hammarby. 2006 utsågs den första Hellapristagare. Det tillföll Matthias Olsson som till säsongen 2007 gick direkt från juniorerna till A-truppen.

Mikael Hellströms åtaganden i Hammarby har inte upphört. Numer hjälper han A-laget med scouting av talanger och motståndare och med matchanalyser. Dessutom är han resurstränare och Tony Gustavssons vakande öga från läktarplats.